這里直接排除那些985工程大學，只談非985的211工程大學。
教育部直屬211，省屬211哪個好？這還真不能一概而論，要看具體學校。一般來說，最好的211工程大學，都是教育部直屬的211工程大學，教育部直屬的211工程大學整體來看也是比地方所屬院校更強。但是教育部直屬的211工程大學數量不少，而且質量參差不齊，強的如北京郵電大學、西安電子科技大學、北京交通大學、中央財經大學、對外經濟貿易大學、上海財經大學等等，弱的如陜西師范大學、長安大學等。那些強勢的211工程大學當然很好，但是弱勢的211工程大學，卻是比不過強勢的地方211工程大學。
相對比較強勢的地方211工程大學，主要在北京、上海、江蘇、廣東等地，這些地方財力相對較強，對學校的投入充分，再加上地理位置好，學校的發(fā)展速度較快。具體包括以下幾所學校。
一、北京工業(yè)大學。1960年建校，初期有北京建筑工程學院、北京工業(yè)學院、北京師范大學部分學生轉入，后來又合并了一些專科類院校。學校以工科專業(yè)為主，雖然沒有特別強勢的專業(yè)，但是土木、機械、計算機、軟件工程、自動化等專業(yè)都比較強。學科評估中B+級以上的學科有9個。
二、上海大學。1983年以復旦大學分校、上海外國語學院分院、華東師范大學儀表電子分校、上?？茖W技術大學分校、上海機械學院輕工分院、上海市美術學校為基礎成立上海大學。1994年由原上海工業(yè)大學、上?？茖W技術大學、原上海大學和上?？萍几叩葘？茖W校合并組建新的上海大學。學校是綜合性大學，學科評估中評級為B+以上的學科有9個，機械、計算機、自動化、通信等專業(yè)相對較好。
三、蘇州大學。前身是1900年創(chuàng)辦的東吳大學。1952年院系調整，東吳大學的文理學院、蘇南文化教育學院、江南大學的數理系合并組建蘇南師范學院，同年更名為江蘇師范學院。1982年恢復校名為蘇州大學。后來蘇州蠶桑?？茖W校、蘇州絲綢工學院、蘇州醫(yī)學院等相繼并入蘇州大學。學科是綜合性大學，學科評估中有B+級以上學科14個，法學、軟件工程、計算機、放射醫(yī)學、紡織工程等專業(yè)相對較好。
四、南京師范大學。1952年全國高校院系調整時，以南京大學、金陵大學等有關院系為基礎，在原金陵女子大學校址組建南京師范學院，所以學校也是原國立中央大學的一個分支。1984年更名為南京師范大學。學科評估中學校有6個A類學科，比沒有A類學科的陜西師范大學，優(yōu)勢十分明顯。
五、華南師范大學。學校位于廣州市。學校校史始于1933年廣東省立勷勤大學師范學院，1950年更名為廣東省文理學院。1951年并入中山大學師范學院、私立華南聯合大學教育系成立華南師范學院。1952年，南方大學俄語系、私立嶺南大學教育系、國立海南師范學院、國立廣西大學教育系、湖南大學史地系地理專修科、國立南昌大學師范部地理專修科和海南師范?？茖W校等院校及系科并入。1970年改稱廣東師范學院，1977年復名為華南師范學院。1982年更名為華南師范大學。華南地區(qū)最好的師范大學。學科評估中有4個A類學科，對標陜西師范大學，華南師范大學也是優(yōu)勢明顯。
其實當年211工程院校的評選，有平衡地區(qū)之間高等教育發(fā)展的因素，很多高等教育落后的省份，都獲得了一個211工程大學的名額，一般稱為照顧性的211工程大學。比如延邊大學、內蒙古大學、太原理工大學、海南大學、貴州大學、西藏大學、寧夏大學、青海大學、新疆大學、石河子大學等等。這些學校即使到目前，整體實力、辦學水平也不算強，甚至不如強勢的雙非大學。當然，這些學校也都是省屬的211工程大學。所以，省屬211工程大學中，除了上述5所大學之外，其他確實不怎么強。當然，這個提問的答案，教育部屬211大學，整體上比省屬211工程大學要好的多。
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其他網友觀點從一般情況來看，肯定是教育部直屬的好。原因如下：
首先，財政撥款較多。一般來說，教育部直屬大學的財政撥款是來源于國家教育部，而省屬高校的撥款主要來源于省財政廳或者教育廳，當然，國家教育部也會給省屬高校一些撥款，但是一般來說都比較少。我們從下面幾個教育部直屬大學2020年的財政撥款數額上，就可以看出來教育部直屬大學的撥款有多豐厚。
其次，學科和平臺有優(yōu)勢。教育部直屬211相比于省屬211，大部分都有更多的頂尖專業(yè)和國家重點實驗室，并且，教育部直屬211的定位是為國家某個或者某些行業(yè)培養(yǎng)頂尖人才，而省屬211，則有點偏于為本省或某些區(qū)域服務。
最后，雖然省屬211和國家教育部直屬211有著一些差距，但是在定位上都是一樣的，都是為了給國家培養(yǎng)高素質人才，而且一般招聘單位也不會刻意去看你所在的211是否為教育部直屬，此外，有很多非教育部直屬211大學，發(fā)展的也不比部屬的差，所以，還是得看具體學校的發(fā)展情況。
總之，從大體上來看，還是教育部直屬的要好一些，并且建國以來國家歷次所確定的重點大學多為目前教育部的直屬高校。
下面附上目前教育部直屬的75所大學名單。
