易點評
在非小細胞肺癌(NSCLC)中，除了少數(shù)可識別的生物標志物外，循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)在檢測突變和監(jiān)測治療效果方面的作用尚未得到很好的研究。因此本文對比了在非小細胞肺癌(NSCLC)病例中，檢測循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)與實體瘤活檢的差異。研究表明，無論患者的臨床狀態(tài)如何，ctDNA都可以通過識別特定的突變來獲取相關(guān)信息。因此，ctDNA可以在癌癥管理和監(jiān)測中為組織活檢提供補充信息，并在組織活檢無法實現(xiàn)的情況下進行檢測，這為癌癥的治療研究做出了巨大貢獻。
研究背景
盡管在過去的十年中癌癥的治療取得了一定進展，但因患肺癌而死亡的人數(shù)仍在不斷攀升。非小細胞肺癌(NSCLC)占所有肺癌病例的85%，并且其對化療具有一定的抗藥性。盡管EGFR和ALK酪氨酸激酶抑制劑(TKIs)等靶向療法常用于非小細胞肺癌的治療，但由于基因亞群的不同，腫瘤的異質(zhì)性限制了靶向治療的效果。雖然組織活檢被認為是指導癌癥治療的金標準，但由于轉(zhuǎn)移性疾病患者病情的不斷惡化，組織活檢往往會有成本高、痛苦、風險大等缺點。此外，組織活檢必然會受到空間異質(zhì)性的影響。眾所周知，腫瘤會將無細胞循環(huán)DNA(CfDNA)釋放到血液中，因此對血漿樣本進行檢測可能是實體瘤組織活檢的替代方法。檢測這些無細胞循環(huán)腫瘤DNA(CtDNA)，也稱為液體活檢，是細胞外DNA的短片段(160-180bp)，被認為是凋亡的腫瘤細胞被酶降解的產(chǎn)物。大多數(shù)使用ctDNA治療NSCLC患者的回顧性研究都集中在單個基因的體細胞突變(通常在EGFR基因中)和相應(yīng)的靶向治療之間的關(guān)系。除了EGFR突變和EGFR靶向TKIs的臨床反應(yīng)之外，液體活檢在轉(zhuǎn)移性肺癌中的作用還沒有被探索。此外，在腫瘤及其非小細胞肺癌ctDNA樣本中，常規(guī)使用ctDNA檢測來監(jiān)測生物標志物以確定突變的臨床有效性是有限的。最近的一項大范圍的ctDNA研究報道了ctDNA檢測中耐藥突變的鑒定頻率和分布與組織活檢相似，并提出ctDNA在組織活檢缺乏的情況下可以作為潛在地首要生物標志物。因此，本研究評估了來自COH癌癥中心的回顧性NSCLC數(shù)據(jù)，來達到以下目的：i)體細胞突變及其在評估預后中的作用；ii)組織和ctDNA樣本之間的一致性；iii)通過重復的ctDNA采樣發(fā)現(xiàn)的癌癥的進展過程。
實驗方法
對2015年11月至2019年8月在COH接受治療的370例成人非小細胞肺癌病例進行回顧性分析，以評估ctDNA在突變鑒定、生存期預測、腫瘤進展以及32個基因與組織樣本一致性等方面的應(yīng)用。
實驗結(jié)果
ctDNA突變分析在370例NSCLC病例的473份ctDNA樣本中，共檢測到1688個體細胞突變。同時，473個樣本中，有177個在FDA批準的非小細胞肺癌療法中有至少一個可操作突變。同時，MET和CDK6擴增與BRAF擴增會同時出現(xiàn)。
組織和ctDNA樣本之間的一致性 通過ctDNA檢測到的SNV、INDELs和擴增比通過組織活檢檢測到的更多。并且，在匹配的樣本中，ctDNA樣本10個目標基因中的突變數(shù)量高于組織活檢。這說明在ctDNA中發(fā)現(xiàn)的靶基因突變比在組織活檢中發(fā)現(xiàn)的更多。
腫瘤的異質(zhì)性和發(fā)展進程對患者進行奧西美替尼治療后，組織活檢中未檢測到EGFR T790M突變，但在ctDNA中檢測到了突變?；颊?/span>G8的EGFR和KRAS突變與組織活檢相比，在四個ctDNA樣本中均未檢測到。因此，雖然ctDNA檢測經(jīng)常在患者G1、G9、G59和G220中發(fā)現(xiàn)可操作突變，但它在檢測患者G8中對突變的檢測是有限的。這表明在ctDNA樣本中檢測出的突變是隨著治療過程和腫瘤進展而變化的。
結(jié)論
雖然ctDNA表現(xiàn)出與組織活檢相似的作用，但在組織活檢中漏掉了更多的靶向基因突變。因此，將組織活檢與ctDNA評估結(jié)合起來，可能有助于檢測更多的靶向突變，以改善晚期非小細胞肺癌的臨床預后。
公司介紹
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基于公司在生命組學與大數(shù)據(jù)信息技術(shù)領(lǐng)域的深厚技術(shù)與資源積累，易基因建設(shè)了易基因云、腫瘤精準醫(yī)學數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)及AI檢索與標志物挖掘算法系統(tǒng)，在癌癥早篩早診、伴隨診斷與輔助診斷、用藥指導等方向進行系列產(chǎn)品開發(fā)，目前已經(jīng)研發(fā)成功了一系列基于DNA甲基化的針對多個癌種的早期預警和預后監(jiān)測標志物產(chǎn)品。同時，公司還自主開發(fā)了血漿游離DNA甲基化高通量測序文庫試劑盒、靶向血漿游離 DNA甲基化測序等技術(shù)，結(jié)合易基因的信息系統(tǒng)與研發(fā)平臺，提供國際領(lǐng)先的科研和技術(shù)產(chǎn)品服務(wù)。還能夠為生物醫(yī)藥公司、高等院校、醫(yī)院和科研院所等提供體外診斷標志物篩選、開發(fā)與驗證，藥物靶點發(fā)現(xiàn)等研發(fā)外包服務(wù)。公司與國內(nèi)外多家知名企業(yè)和單位建立了戰(zhàn)略合作關(guān)系，共同致力于為生物醫(yī)藥領(lǐng)域提供性能卓越的產(chǎn)品和優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。如果您有任何醫(yī)療、科研上的問題和需求請聯(lián)系我們！
