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          Molecular Cell丨2020年第80卷第1期導(dǎo)讀——新型冠狀病毒、復(fù)制體、剪接體、基因組維...
          導(dǎo)語:北京時間2020年10月2日,Molecular Cell 在第80卷第1期共發(fā)表11篇研究性文章,內(nèi)容涉及多方面,如新型冠狀病毒、代謝、免疫、心臟病、乳腺癌、基因組維持、DNA復(fù)制和RNA加工等。





           (p)ppGpp是細菌在營養(yǎng)饑餓后普遍產(chǎn)生的一種核苷酸信使,在大腸桿菌中,ppGpp通過靶向幾種不同的酶抑制嘌呤核苷酸的合成,但其抑制作用的生理意義尚不清楚。美國麻省理工學(xué)院的Michael T. Laub團隊發(fā)表文章“ppGpp Coordinates Nucleotide and Amino-Acid Synthesis in E. coli During Starvation”,證明ppGpp可直接抑制嘌呤核苷酸挽救酶Gsk,利用對ppGpp不敏感的Gsk變體,揭示了在饑餓期間抑制嘌呤核苷酸的合成的必要性,即維持合成組氨酸和色氨酸所需的代謝物pRpp的水平。

          原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.08.005



          免疫細胞的功能依賴于線粒體的特定代謝程序,包括營養(yǎng)氧化、大分子合成和翻譯后修飾。線粒體適應(yīng)與急性和慢性炎癥有關(guān),但其代謝線索和確切機制仍不清楚。浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院王迪團隊發(fā)表文章“Histone Deacetylase 3 Couples Mitochondria to Drive IL-1β-Dependent Inflammation by Configuring Fatty Acid Oxidation”,揭示組蛋白去乙酰化酶3(HDAC3)可轉(zhuǎn)運至線粒體,使脂肪酸氧化酶HADHA去乙?;瑥亩龠MNLRP3炎癥小體的最佳激活(Mol Cell | 王迪組揭示巨噬細胞炎癥過程中獲取脂質(zhì)代謝和線粒體適應(yīng)性的新機制)。

          原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.08.015



          β1-腎上腺素能受體(β1-AR)是心臟功能的主要調(diào)節(jié)因子,在大多數(shù)心力衰竭患者中表達下調(diào),其參與的一個關(guān)鍵的生理過程是激活異源三聚體G蛋白Gs,導(dǎo)致心率和收縮力增加。美國康奈爾大學(xué)的Xin-Yun Huang團隊發(fā)表文章“Structural Basis of the Activation of Heterotrimeric Gs-Protein by Isoproterenol-Bound β1-Adrenergic Receptor”,報道了異丙腎上腺素結(jié)合β1-AR與異源三聚體Gs蛋白復(fù)合物的冷凍電鏡結(jié)構(gòu),揭示了β1-AR對Gs的激活,增強了人們對由神經(jīng)系統(tǒng)和激素控制心率和收縮力的理解。

          原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.08.001



          膜蛋白的生物合成面臨著伴侶疏水性跨膜螺旋以實現(xiàn)膜的精確插入的困難,尾部錨定(TA)蛋白引導(dǎo)的進入(GET)通路可通過插入酶(可從細胞質(zhì)伴侶中捕獲TA)靶向并將TA蛋白插入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜。德國海德堡大學(xué)的Irmgard Sinning團隊發(fā)表文章“Structural Basis of Tail-Anchored Membrane Protein Biogenesis by the GET Insertase Complex”,描述了與Get3細胞質(zhì)伴侶結(jié)合的GET插入酶的結(jié)構(gòu),揭示了由插入酶Get1/ Get2同源物指導(dǎo)的尾部錨定蛋白的膜插入需要脂質(zhì)穩(wěn)定的四聚體、保守的細胞質(zhì)螺旋α3’和嵌入膜的親水凹槽的協(xié)同作用。

          原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.08.012



          在乳腺癌中,絲氨酸/蘇氨酸激酶Akt經(jīng)常通過多種機制被過度激活,包括PI3K激活、PTEN缺失和ErbB2/Her2/neu激活/擴增,然而,之前關(guān)于Akt亞型在乳腺癌中的作用的研究結(jié)果不一致且存在爭議。美國伊利諾伊大學(xué)芝加哥分校的Nissim Hay團隊發(fā)表文章“Cell-Autonomous versus Systemic Akt Isoform Deletions Uncovered New Roles for Akt1 and Akt2 in Breast Cancer”,發(fā)現(xiàn)腫瘤檢測后可誘導(dǎo)的系統(tǒng)性Akt1缺失可以通過抑制腫瘤相關(guān)中性粒細胞抑制Akt過度激活的腫瘤的乳腺癌轉(zhuǎn)移,而可誘導(dǎo)的系統(tǒng)性Akt2缺失則不能抑制乳腺癌的發(fā)生和轉(zhuǎn)移。由此提示,無論腫瘤來源如何,特異性抑制Akt1可以治療乳腺癌轉(zhuǎn)移。

          原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.08.017



          DNA依賴性蛋白酶修復(fù)共價DNA蛋白質(zhì)交聯(lián)(DPC)是細胞生存和腫瘤抑制所必需的一種基因組維持機制。然而,如何將蛋白質(zhì)水解限制在交聯(lián)蛋白上,而使周圍的染色質(zhì)蛋白不受損傷,仍然是個未知數(shù)。德國慕尼黑大學(xué)的Julian Stingele團隊發(fā)表文章“DNA Structure-Specific Cleavage of DNA-Protein Crosslinks by the SPRTN Protease”,表明蛋白酶SPRTN以DNA結(jié)構(gòu)特異性的方式降解DNA-蛋白質(zhì)交聯(lián),從而限制了對生物學(xué)相關(guān)的其他未知的裂解。核磁共振分析表明,這種特異性是通過一種依賴于兩個DNA結(jié)合界面的雙向策略實現(xiàn)的,可以識別底物中的單鏈和雙鏈特征。

          原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.08.003



          DNA復(fù)制是由一個叫做復(fù)制體的多蛋白質(zhì)機器來完成的,在酵母中,復(fù)制體由30多種不同的蛋白質(zhì)組成,這些蛋白質(zhì)被排列成多個亞組分,每一個都有不同的活性,這些活性的同步是有效復(fù)制和保存基因組完整性所必需的。而這一點是如何在后隨鏈中實現(xiàn)的尤其令人困惑。加拿大麥吉爾大學(xué)的Rodrigo Reyes-Lamothe團隊發(fā)表文章“Processive Activity of Replicative DNA Polymerases in the Replisome of Live Eukaryotic Cells”,通過在活的出芽酵母中建立單分子方法,測定了真核生物復(fù)制體的結(jié)合動力學(xué),表明前導(dǎo)鏈聚合酶Pol δ和后隨鏈聚合酶Pol ?穩(wěn)定地結(jié)合在復(fù)制體上,相反,Pol α引物酶則在解離前執(zhí)行很少的啟動循環(huán)。

          原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.08.014



          人類剪接體含有許多酵母中不存在的蛋白質(zhì),它們的功能在很大程度上仍不為人所知。德國馬克斯·普朗克生物物理化學(xué)研究所的Reinhard Luhrmann團隊發(fā)表文章“Structural Insights into the Roles of Metazoan-Specific Splicing Factors in the Human Step 1 Spliceosome”,以3.4埃核心分辨率獲得人類剪接體C復(fù)合體的冷凍電鏡結(jié)構(gòu),為剪接體在剪接步驟1和2之間的分子結(jié)構(gòu)以及蛋白質(zhì)在剪接體催化活性RNP構(gòu)象形成中的作用提供了新的見解。

          原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.09.012




          神經(jīng)元比其他細胞表達更長的3’UTR,選擇性多聚腺苷酸化(APA)產(chǎn)生的高度延伸的神經(jīng)3'UTR亞型的組織特異性分布是多細胞動物基因組廣泛而保守的特征,然而,控制神經(jīng)APA亞型的因素和機制尚不清楚。美國紀念斯隆-凱特琳研究所的Eric C. Lai團隊發(fā)表文章“Overlapping Activities of ELAV/Hu Family RNA Binding Proteins Specify the Extended Neuronal 3’ UTR Landscape in Drosophila”,證實果蠅ELAV/Hu RNA結(jié)合蛋白的重疊作用對于決定延伸的3' UTR背景是必要充分條件,此外,其代償功能還包括ELAV/ Hu成員之間的剪接和亞細胞調(diào)節(jié)。
             
          原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.09.007



          選擇性RNA變體的產(chǎn)生有助于基因表達的組織特異性調(diào)控,在動物神經(jīng)系統(tǒng)中,向轉(zhuǎn)錄終止末端的系統(tǒng)性轉(zhuǎn)移可以產(chǎn)生對神經(jīng)元的發(fā)育和功能至關(guān)重要的轉(zhuǎn)錄信號。德國馬克斯·普朗克免疫生物和表觀遺傳研究所的Vale′rie Hilgers團隊發(fā)表文章“ELAV and FNE Determine Neuronal Transcript Signatures through EXon-Activated Rescue”,表明兩種神經(jīng)元特異性RNA結(jié)合蛋白ELAV和FNE決定了神經(jīng)元mRNA的特異性,當(dāng)不被ELAV抑制時,F(xiàn)NE經(jīng)歷一個功能轉(zhuǎn)換,在一個稱為外顯子激活的功能拯救過程中挽救神經(jīng)元的3'末端加工和剪接。

          原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.09.011

          十一


          新冠仍在全球肆虐,可靠治療方法的開發(fā)迫在眉睫,但是對SARS-CoV-2感染的分子過程和宿主細胞信號事件了解的缺乏阻礙了治療的發(fā)展。德國法蘭克福大學(xué)的Jindrich Cinatl團隊發(fā)表文章“Growth Factor Receptor Signaling Inhibition Prevents SARS-CoV-2 Replication”,剖析了感染SARS-CoV-2后宿主細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的情況。不同的信號網(wǎng)絡(luò)圖譜確定了感染期間激活的許多通路,而藥物靶點網(wǎng)絡(luò)分析揭示了潛在的治療靶點。其中生長因子受體信號在感染后被高度激活,抑制該信號可以抑制SARS-CoV-2在細胞中的復(fù)制。

          原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.08.006
          制版人:schweine
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