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          NGS 檢測(cè)及其應(yīng)用

          NGS 檢測(cè):高通量測(cè)序技術(shù)(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測(cè)序技術(shù)("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長(zhǎng)較短等為標(biāo)志。

          Ngs檢測(cè)

            高通量測(cè)序技術(shù)(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測(cè)序技術(shù)("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長(zhǎng)較短等為標(biāo)志。更多內(nèi)容可關(guān)注盛景基因。

            Ngs基因檢測(cè)

            高通量測(cè)序經(jīng)過(guò)近十年來(lái)的迅猛發(fā)展,已經(jīng)深入到生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域,不僅有力地推動(dòng)了基礎(chǔ)研究的發(fā)展,也在逐漸征服臨床應(yīng)用。

            與Sanger法為代表的傳統(tǒng)測(cè)序法相比,高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有顯著的優(yōu)勢(shì),又快(兩天)又多(數(shù)百萬(wàn)克隆),成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。

            當(dāng)前主要的測(cè)序技術(shù)平臺(tái)

            1、solexa測(cè)序技術(shù)(即大家耳熟能詳?shù)膇llumina測(cè)序平臺(tái));

            2、454測(cè)序技術(shù)(讀長(zhǎng)長(zhǎng),但是準(zhǔn)確度較低,成本較高,即焦磷酸測(cè)序技術(shù),少量市場(chǎng)占有);

            3、solid測(cè)序技術(shù)(雙色編碼技術(shù),目前基本在市場(chǎng)上見(jiàn)不到了)

            Ngs基因檢測(cè)分類

            根據(jù)發(fā)展歷史、影響力、測(cè)序原理和技術(shù)不同等,主要有以下幾種:

          大規(guī)模平行簽名測(cè)序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、

          聚合酶克隆(Polony Sequencing)、

          454焦磷酸測(cè)序(454 pyrosequencing)、

          Illumina (Solexa) sequencing、

          ABI SOLiD sequencing、

          離子半導(dǎo)體測(cè)序(Ion semiconductor sequencing)、

          DNA 納米球測(cè)序 (DNA nanoball sequencing)等。

            高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次革命性的改變,一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測(cè)序技術(shù)(next generation sequencing)足見(jiàn)其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測(cè)序(deep sequencing)。

          1、高通量測(cè)序在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的應(yīng)用:

          包括疾病基因的篩查,大規(guī)模測(cè)病人和正常人的基因,通過(guò)基因比較,得出與疾病可能相關(guān)的基因,后續(xù)再診斷這一疾病,即可篩查病人是否有這些基因的突變。比如乳腺癌,現(xiàn)已有較成熟的基因篩查方法。

          高通量測(cè)序技術(shù)的誕生可以說(shuō)是基因組學(xué)研究領(lǐng)域一個(gè)具有里程碑意義的事件。該技術(shù)使得核酸測(cè)序的單堿基成本與第一代測(cè)序技術(shù)相比急劇下降, 以人類基因組測(cè)序?yàn)槔? 上世紀(jì)末進(jìn)行的人類基因組計(jì)劃花費(fèi) 30 億美元解碼了人類生命密碼;

           而第二代測(cè)序使得人類基因組測(cè)序已進(jìn)入萬(wàn)(美)元基因組時(shí)代。如此低廉的單堿基測(cè)序成本使得我們可以實(shí)施更多物種的基因組計(jì)劃從而解密更多生物物種的基因組遺傳密碼。同時(shí)在已完成基因組序列測(cè)定的物種中, 對(duì)該物種的其他品種進(jìn)行大規(guī)模地全基因組重測(cè)序也成為了可能。

          2、古基因組學(xué)的應(yīng)用:

          對(duì)于已經(jīng)滅絕的生物,可通過(guò)考古獲得的動(dòng)物毛發(fā)、骨骼對(duì)該物種測(cè)序,還可通過(guò)樣品中微生物基因組分析,判斷該物種當(dāng)時(shí)的生活環(huán)境。

          如猛犸象線粒體基因組的測(cè)序,發(fā)現(xiàn)猛犸象基因復(fù)雜度低,存在高度不穩(wěn)定性,可能這導(dǎo)致了該物種適應(yīng)環(huán)境能力低,在一部分程度上導(dǎo)致了該物種的滅絕。

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