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          【每周一課】NO.86 鄔玲仟教授:產(chǎn)前遺傳病檢測方法



          本期主講



          鄔玲仟,醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)博士,教授,婦產(chǎn)科一級主任醫(yī)師,博士生導(dǎo)師?,F(xiàn)任中南大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任、湘雅醫(yī)院產(chǎn)前診斷中心主任、湘雅醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)中心副主任、湖南家輝遺傳??漆t(yī)院首席醫(yī)學(xué)遺傳醫(yī)師。兼任中國醫(yī)師協(xié)會醫(yī)學(xué)遺傳醫(yī)師分會會長、中華醫(yī)學(xué)會醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)分會副主任委員、國家衛(wèi)計(jì)委產(chǎn)前診斷專家組專家、產(chǎn)前診斷培訓(xùn)基地負(fù)責(zé)人。長期致力于遺傳病發(fā)病機(jī)制、診斷與產(chǎn)前診斷技術(shù)研究、教學(xué)和臨床服務(wù),率先在國內(nèi)建立了以微芯片和高通量測序技術(shù)為核心的遺傳病診斷和產(chǎn)前診斷高技術(shù)平臺及其技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)和規(guī)范、研發(fā)“染色體非整倍體無創(chuàng)產(chǎn)前篩查技術(shù)”在國際上首家獲得臨床許可并在全國推廣應(yīng)用,創(chuàng)建“循環(huán)單分子擴(kuò)增重測序技術(shù)(cSMART)”率先突破單基因病無創(chuàng)產(chǎn)前診斷,被美國臨床化學(xué)學(xué)會(AACC)譽(yù)為“分子診斷的革命性突破”。


          【本期課程摘要】




          一、產(chǎn)前診斷


          1. 產(chǎn)前診斷(prenatal diagnosis)的定義:是指對胎兒進(jìn)行先天性缺陷和遺傳性疾病的診斷,檢測手段包括:影像學(xué)、生物化學(xué)、細(xì)胞和分子遺產(chǎn)學(xué),以及分子生物學(xué)等。


          2. 產(chǎn)前診斷的好處:(1)陰性結(jié)果使孕婦安心;(2)明確診斷疾病,部分疾病可提供產(chǎn)前治療;(3)選擇合適的生育場所盡可能保證安全分娩;(4)選擇合適醫(yī)院對患病胎兒提供出生時(shí)治療;(5)提供終止妊娠的機(jī)會;以利于提高人口素質(zhì),降低出生缺陷。


          二、遺傳病與遺傳學(xué)檢測方法


          1. 遺傳病包括:染色體?。òㄈ旧w數(shù)目異常、片段缺失與重復(fù)、微缺失與微重復(fù))、基因組病、單基因?。▎位虿 ⒍嗷虿?、線粒體病),多基因病,體細(xì)胞突變遺傳病等。


          2. 產(chǎn)前診斷的對象是嚴(yán)重遺傳性疾病,是指由于遺傳因素先天形成,患者全部或者部分喪失自主生活能力,后代再現(xiàn)風(fēng)險(xiǎn)高,醫(yī)學(xué)上認(rèn)為不宜生育的遺傳性疾病,包括染色體病、基因組病以及一部分嚴(yán)重的致愚、致殘、致死性的單基因病。


          3. 遺傳學(xué)檢測方法

          染色體病和基因組病目前已經(jīng)有很好的檢測平臺,染色體疾病診斷顯帶技術(shù)平臺可以一次性看到46條染色體數(shù)目或結(jié)構(gòu)異常;基因組病染色體微缺失微重復(fù)診斷技術(shù)平臺通過芯片或高通量測序,也可以一次性看到整個(gè)細(xì)胞基因組的異常;但是,單基因疾病共有7000多個(gè),目前能夠檢測的有3000多個(gè),不同的疾病有不同的遺傳病理特點(diǎn),選擇的檢測方法也不一樣,因此,臨床醫(yī)生需要對這部分疾病有深刻的認(rèn)識,選擇恰當(dāng)?shù)臋z測技術(shù),才能更好地實(shí)現(xiàn)產(chǎn)前診斷和咨詢。


          遺傳學(xué)檢測方法包括以下幾種:

          1)染色體核型分析:通過顯帶技術(shù)(如G顯帶)來檢測染色體數(shù)目或結(jié)構(gòu)是否存在異常;其分辨率有限,多大于5MB(整個(gè)基因組是2.8GB,大部分實(shí)驗(yàn)室是做320-400條帶,這種情況就要大于10MB),因此無法分辨小的染色體缺失或重復(fù)。

          2)基因組拷貝數(shù)變異檢測:通過染色體微陣列芯片(如SNP-array)等方法檢測染色體微小片段的缺失或重復(fù);分辨率>100KB,也有局限性,無法分辨幾個(gè)KB片段的缺失或插入。

          下圖所示為一例染色體插入突變病例,患者表現(xiàn)為智障,小頭畸形,生活可以自理,當(dāng)?shù)夭槿旧w核型為正常,芯片結(jié)果顯示9號染色體長臂有16MB的重復(fù)。



          3)Sanger測序和MLPA技術(shù):對于單個(gè)堿基水平,可利用sanger測序,即一代測序,分辨率從1bp到數(shù)百bp,可用于檢測單個(gè)基因;MLPA(多重連接探針擴(kuò)增技術(shù))若是針對一個(gè)基因的一到兩個(gè)外顯子的缺失或重復(fù),或是針對靶序列的點(diǎn)突變、缺失或重復(fù)的檢測。

          4)二代測序(NGS):可以一次檢測單個(gè)基因(single gene)、一組基因(gene panel)、在線人類孟德爾遺傳 (Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)基因外顯子、外顯子組(exome),及全基因組(whole genome);分辨率達(dá)到1bp?,F(xiàn)在隨著這項(xiàng)技術(shù)的價(jià)錢逐漸降低,應(yīng)用得到推廣,但后兩種檢測由于其價(jià)格相對較高,分辨率高,會發(fā)現(xiàn)大量無法與表型關(guān)聯(lián)的變異,一般用于用于新生兒先證者的檢測。


          下表展示了各種遺傳學(xué)檢測方法的優(yōu)缺點(diǎn):



          三、遺傳學(xué)檢測方法在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用


          1.評估

          1)評估胎兒患遺傳病的風(fēng)險(xiǎn):

          a)胎兒狀態(tài):有無畸形、生長發(fā)育遲緩等;

          b)孕婦孕期有無特殊:孕婦年齡,是否接觸有害物質(zhì),產(chǎn)前篩查有無異常等;

          c)其他:羊水量,胎盤狀況,是否為試管嬰兒等;

          d)家族史:非常重要,夫婦是否為染色體異常攜帶者,是否生育過嚴(yán)重缺陷新生兒,家族中是否有遺傳病患者等。

          2) 評估胎兒患遺傳病的種類:

          a)染色體?。孩傺蛩^多或者過少;②胎兒發(fā)育異常或者有可疑畸形;③孕早期接觸過可能導(dǎo)致胎兒先天缺陷的物質(zhì);④曾經(jīng)分娩過先天性嚴(yán)重缺陷嬰兒或者生育過染色體異?;純?;⑤夫婦雙方之一為染色體平衡易位、倒位或插入攜帶者;⑥孕婦年齡超過35周歲;⑦產(chǎn)前篩查提示胎兒染色體疾病高風(fēng)險(xiǎn)。

          b)基因組異常?。?①胎兒發(fā)育異常或者有可疑畸形;②孕早期接觸過可能導(dǎo)致胎兒先天缺陷的物質(zhì);③夫婦曾生育過智力低下、發(fā)育遲緩或器官畸形的患兒,且經(jīng)過遺傳學(xué)檢測診斷為基因組??;④夫婦雙方之一為基因組病攜帶者;⑤產(chǎn)前篩查提示胎兒基因組疾病高風(fēng)險(xiǎn)。

          基因組病異常的評估標(biāo)準(zhǔn)大體與染色體病相似,但其獨(dú)有的一大特點(diǎn)是與母親年齡無關(guān),只與基因組自身結(jié)構(gòu)有關(guān),每個(gè)個(gè)體基因組都含有低拷貝重復(fù)序列、串聯(lián)重復(fù)序列等,這些重復(fù)序列發(fā)生非等位同源重組,導(dǎo)致染色體的缺失或重復(fù),通常為小片段缺失或重復(fù),可以導(dǎo)致智力障礙,生長發(fā)育遲緩,及多發(fā)畸形等。

          c)單基因?。孩俜驄D為隱性致病基因攜帶者或夫婦一方是顯性遺傳病患者;②曾生育過單基因病患兒;③胎兒發(fā)現(xiàn)明顯畸形,高度懷疑為某一遺傳?。ù朔N產(chǎn)前診斷較為困難)。

          d)線粒體疾病、多基因遺傳病、體細(xì)胞突變遺傳?。号c單基因病類似,但其產(chǎn)鉗診斷膠南進(jìn)行,且由于很難以評估胎兒將來表型。一般不做產(chǎn)前診斷。

          3)評估孕婦能否進(jìn)行有創(chuàng)產(chǎn)前診斷:

          a)有創(chuàng)產(chǎn)前診斷的禁忌癥:①完全性前置胎盤;②先兆流產(chǎn)未穩(wěn)定;③孕婦體溫超過37.2℃。

          b)有創(chuàng)產(chǎn)鉗診斷慎用:①邊緣性或部分性前置胎盤;②孕婦為病毒攜帶者,如HBV,HIV;③孕婦血性為RH陰性。


          2.檢測

          1)選擇合適的取材方法和時(shí)間:

          下表為不同取材方式的手術(shù)時(shí)間,胎兒丟失率及并發(fā)癥風(fēng)險(xiǎn):



          2)選擇恰當(dāng)?shù)倪z傳學(xué)方法進(jìn)行檢測:

          研究顯示,如胎兒B超有異常,基因芯片檢測,遺傳疾病檢出異常檢出率為6%,如B超無異常,只是篩查高風(fēng)險(xiǎn),基因芯片遺傳異常的檢出率1. 7%,有顯著性差異。指南規(guī)定建議,如B超有異常,首先做芯片或高通量測序,而不是染色體核型檢測;如B超無異常,只是篩查高風(fēng)險(xiǎn),可以選擇染色體核型或芯片檢測。單基因疾病是根據(jù)特定疾病來選擇相應(yīng)的檢測方式。


          下面以假肥大性肌營養(yǎng)不良(DMD)來說明單基因病如何選擇恰當(dāng)?shù)倪z傳學(xué)方法進(jìn)行檢測。


          首先,對710例DMD樣本基因檢測結(jié)果進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)陽性結(jié)果占94.5%,其中大片段缺失或重復(fù)變異占72.7%,單個(gè)或小片段核苷酸變異占21.8%,陰性結(jié)果占5.5%。因此,DMD先證者診斷首選MLPA,先找大片段的缺失或重復(fù),若MLPA陰性,再做一代或二代測序,尋找點(diǎn)突變,若結(jié)果為陰性,原因可能為診斷錯(cuò)誤或突變不在檢測的目標(biāo)區(qū)域內(nèi)。DMD檢測流程見下圖。


          由此可見,先證者的診斷了解單基因病的突變類型非常重要,有助于選擇恰當(dāng)?shù)臋z測方法,并幫助確認(rèn)臨床診斷的正確性。



          3.結(jié)果:

          1)分析檢測結(jié)果:

          a)陽性結(jié)果:確定胎兒患遺傳?。?/span>

          b)陰性結(jié)果:排除胎兒患某種或某類遺傳病風(fēng)險(xiǎn);

          c)臨床意義不明的結(jié)果:發(fā)現(xiàn)有變異,但不能確定該變異是否會導(dǎo)致胎兒患病。原因是染色體異常大部分是新發(fā)的,拷貝數(shù)變異(CNV)更是90%以上是新發(fā)的,即父母染色體正常,但在受精卵形成的過程中產(chǎn)生異常。這一類結(jié)果尤其要做好遺產(chǎn)咨詢,并且要做好新生兒隨訪,形成數(shù)據(jù)庫,以指導(dǎo)以后相同結(jié)果的咨詢。

          下圖為臨床意義不明的結(jié)果的一個(gè)案例:


          d)意外發(fā)現(xiàn):發(fā)現(xiàn)與檢測目的無關(guān)的信息。

          2)遺傳咨詢:

          a)遺傳咨詢(Genetic Counseling)定義:是由臨床醫(yī)生和遺傳學(xué)工作者,解答遺傳病患者及家屬剔除提出的有關(guān)遺傳性疾病的病因、遺傳方式、診斷、治療及預(yù)防等問題,估計(jì)后代再患某病的概率,并提出建議及指導(dǎo),一共以供患者及其親屬參考。

          b)產(chǎn)前診斷中遺傳咨詢的特殊性:

          i.胎兒不一定在孕期表現(xiàn)出相應(yīng)的表型;

          ii.是否建議孕婦終止妊娠(倫理、種族、宗教等);

          iii.檢測材料的特殊性;

          iv.懷孕時(shí)間與檢測時(shí)間的矛盾性。

          c)幾種特殊情況:

          i.嵌合體:很難評估表型,可以在咨詢中告知最嚴(yán)重和最輕的情況;

          ii.外顯不全:在一個(gè)家系里,有的癥狀嚴(yán)重,有的癥狀很輕,要將這種情況告知病人;

          iii.延遲顯性:根據(jù)患者的要求,若有治療的方法要告知患者以利于及早治療。


          下圖顯示的是8號染色體三體嵌合體的一個(gè)案例。該案例中患者沒有智力障礙和嚴(yán)重畸形,生活可以自理,就診原因是妻子反復(fù)流產(chǎn)兩次。行143個(gè)核型分析,其中138個(gè)8號染色體三體,僅有5個(gè)核型正常。


          鄔教授分享的最后一個(gè)案例是脆性X綜合征(fragile X syndrome),典型的臨床表現(xiàn)為臉長,耳朵大,巨睪丸,智力障礙等。下圖及表展示了其遺傳病理學(xué)。



          如上表所示,CGG重復(fù)數(shù)在正常人為5-44次;當(dāng)重復(fù)達(dá)到55-200次,其轉(zhuǎn)錄增加,翻譯減少,女性表現(xiàn)為卵巢早衰, 男性50歲左右會共濟(jì)失調(diào)和震顫;當(dāng)重復(fù)達(dá)到200以上,基因上游CpG島會甲基化,導(dǎo)致基因沉默,男性導(dǎo)致智力障礙,女性根據(jù)X染色體失活比例不同,有些成為攜帶者而表型正常,有些表型為脆性X綜合征。


          脆性X綜合征中,超過95%是由于CGG重復(fù)擴(kuò)展的動態(tài)突變和異常甲基化而導(dǎo)致的FMRP蛋白合成減少或缺失所致;不到5%是由于FMR1基因的缺失突變或點(diǎn)突變而導(dǎo)致FMRP蛋白功能異常而致?。贿€有12-41%的患者存在嵌合。


          綜合以上情況,下表展示了脆性X綜合征的檢測策略??梢钥闯?,在檢測策略中,用熒光PCR作為篩查手段,產(chǎn)前診斷用Southern基因組印記,原因是CG之間有三個(gè)氫鍵,導(dǎo)致其連接緊密,因此CG含量高PCR擴(kuò)增難,而脆性X綜合征的診斷需要把大片段的CGG重復(fù)擴(kuò)增出來,PCR檢測常只有存在短片段擴(kuò)增的優(yōu)勢擴(kuò)增,長的擴(kuò)增不出來,于是會漏掉嵌合狀況。






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          北京晚報(bào)
          原來無創(chuàng)產(chǎn)前篩查的原理這么簡單——好開森!??!
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