工程審計是一項專業(yè)性的審計活動，工程審計不好，容易出現(xiàn)造價和工程竣工方面的損失。工程審計常見的六個問題主要有：合同管理方面、概算執(zhí)行方面、設(shè)計管理方面、甲供材料和設(shè)備管理方面、工程管理方面和結(jié)算管理方面。
一、合同管理方面
合同是項目當事雙方的契約，所有的項目行為都應(yīng)該在合同框架內(nèi)做出明確，沒有合同容易產(chǎn)生法律糾紛；合同約定不清楚，容易給項目實施和結(jié)算帶來矛盾隱患。
有的項目做完工程后再簽合同；有得項目合同對關(guān)鍵性條款控制不嚴，例如：合同對工程的范圍、內(nèi)容、標準規(guī)定不明確；合同對結(jié)算條款規(guī)定不細致；合同規(guī)定的付款比例與有關(guān)規(guī)定不符，未預(yù)留質(zhì)保金；合同對違約責任規(guī)定不足，缺乏對違約方的制約等等。
二、概算執(zhí)行方面
概算是項目執(zhí)行的依據(jù)，項目要做什么，按照什么標準做，花多少錢，都在概算中做了規(guī)定。項目實施的所有內(nèi)容后和投資控制都應(yīng)與概算對應(yīng)，個別不在概算內(nèi)的內(nèi)容，應(yīng)當向概算審批單位申報批準。
有的項目實施過程不按照概算批復(fù)執(zhí)行，例如：擅自提高建設(shè)標準；擴大建設(shè)范圍；將不屬于概算范圍內(nèi)的工程納入項目建設(shè)；項目出現(xiàn)重大設(shè)計變更不報批等等。
三、設(shè)計管理方面
設(shè)計圖紙和設(shè)計變更是工程實施過程中重要的管理文件，也是項目結(jié)算的重要依據(jù)，很多施工單位希望通過設(shè)計圖紙和設(shè)計變更增加工程結(jié)算。所以設(shè)計文件管理的審計是一項重要的工作，在某些項目中甚至成為最關(guān)鍵的審計環(huán)節(jié)。
有的項目設(shè)計深度不夠，重要數(shù)據(jù)提示不清，造成結(jié)算時候無據(jù)可依；有的項目只有部分設(shè)計圖紙就開始招標，造成招標后造價失控；設(shè)計圖紙的編制單位不具備出圖資格，出具假的設(shè)計變更等等。
四、甲供材料和設(shè)備管理方面
甲供材料和設(shè)備是工程項目中建設(shè)單位采購的工程物資，應(yīng)按照工程的設(shè)計需要進行采購和發(fā)放。在有的工程項目中，甲供材料和設(shè)備的投資占比很大，如果管理不好，很容易成為某些人弄虛作假或滋生腐敗的手段，所以在審計工作中必須重視這一部分。
五、工程管理方面
工程管理是項目實施的執(zhí)行部分，是所有管理工作中最具體最直接的部分，涉及工程內(nèi)容是否按照合同完成、簽證的記錄、工期能否滿足合同條件、工程質(zhì)量是否達到約定標準等等，所有的投資完成最后都要反映在工程的成果中，是工程結(jié)算最重要的參考。工程實施的過程也是工程成本形成的過程，其過程的記錄對工程的結(jié)算具有重要意義。
六、結(jié)算管理方面
結(jié)算管理可以說是審計工作的核心工作，直接涉及大額工程費用的支出，而結(jié)算的成功必須與結(jié)算依據(jù)對應(yīng)，同時還要認真核對計算的過程。這里需要具備對整個項目各個環(huán)節(jié)的系統(tǒng)性思考，也需要扎實的造價專業(yè)知識。
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