從品級上說，佛珠可以分為三品：
上品佛珠：
1080顆或者是180顆。（見《金剛頂瑜伽念珠經(jīng)》）或一百零八顆（見《文殊儀軌經(jīng)》）
1080顆按天臺宗理論，十界無不性具善惡，故1080數(shù)目表示十界各有一百零八種煩惱，合成一千零八十種煩惱?！笆纭北硎菊麄€迷與悟的世界，即：1、地獄界，2、餓鬼界，3、畜生界，4、修羅界，5、人間界，6、天上界，7、聲聞界，8、緣覺界，9、菩薩界，10、佛界。
108 顆表示求正百八三昧，斷除一百零八種煩惱。一百零八種煩惱一般說法是六根 （眼、耳、鼻、舌、身、意） 各有苦、樂、舍三受， 合為十八種。六根各有好、惡、平三種， 合為十八種，總計三十六種，再以過去、現(xiàn)在、未來三世合為一百零八種煩惱。
中品佛珠：
54顆、42顆、36顆。（見《金剛頂瑜伽念珠經(jīng)》和《文殊儀軌經(jīng)》）
54顆表示菩薩修行過程中的五十四個位次，其中包括十信、十住、十行、十回向、十地五十階位，再加上四善根位。
分述如下：
十信： 1、信心，2、念心，3、精進(jìn)心，4、慧心，5、定心，6、護(hù)法心，7、回向心，8、戒心，9、舍心，10、愿心。
十?。?1、初發(fā)心住，2、治地住，3、修行住，4、生貴住，5、方便具足住，6、正心住，7、不退住，8、童真住，9、法王子住，10、灌頂住。
十行： 1、歡喜行，2、饒益行，3、無瞋恨行，4、無盡行，5、離癡亂行，6、善現(xiàn)行，7、無著行，8、尊重行，9、善法行，10、真實(shí)行。
十回向： 1、救護(hù)一切眾生離眾生相回向，2、不壞回向，3、等一切佛回向，4、至一切處回向，5、無盡功德藏回向，6、隨順平等善根回向，7、隨順等觀一切眾生回向，8、如相回向，9、無縛無著解脫回向，10、法界無量回向。
十地： 1、歡喜地，2、離垢地，3、發(fā)光地，4、焰慧地，5、難勝地，6、現(xiàn)前地，7、遠(yuǎn)行地，8、不動地，9、善慧地，10、法云地。
四善根： 指見道以前，觀四諦及修行十六行相以達(dá)到無漏圣位的四種修行階位，包括：1、暖位，2、頂位，3、忍位，4、世第一法位。
42顆表示菩薩修行過程的四十二階位，即十住、十行、十回向、十地、等覺和妙覺。等覺：又作等正覺，即指在內(nèi)容上與佛相等，而實(shí)際修行上比佛略遜一籌者。如欲詳細(xì)了解，請參閱鳩摩羅什譯《仁王般若波羅蜜經(jīng)·受持品》。
36顆無確切的含義，通常皆認(rèn)為是為了便于攜帶，遂三分一百零八顆成三十六顆，其中蘊(yùn)含有以小見大的義理，故與一百零八顆相同。
下品佛珠：
27顆以下。（見《金剛頂瑜伽念珠經(jīng)》和《文殊儀軌經(jīng)》）
27顆表示小乘修行四向四果的二十七賢圣位，即前四向三果的“十八有學(xué)”與第四阿羅漢果的“九無學(xué)”。
21顆表示十地、十波羅蜜、佛果?！笆亍币姟拔迨念w”一段，“十波羅蜜”見“弟子珠” 而“佛果”指達(dá)到最究竟成佛的果位。
18顆俗稱“十八子”，此中所謂“十八”指的是“十八界”，即六根、六塵、六識。
六根：1、眼界，2、耳界，3、鼻界，4、舌界，5、身界，6、意界；
六塵：1、色塵，2、聲塵，3、香塵，4、味塵，5、觸塵，6、法塵；
六識：1、眼識，2、耳識，3、鼻識，4、舌識，5、身識，6、意識。
14顆則表示觀音菩薩與十方、三世、六道等一切眾生同一悲仰，令諸眾生獲得十四種無畏的功德。十四無畏：
1、使眾生返照自性，獲得解脫；
2、使眾生旋轉(zhuǎn)知見，茍遇火難，火不能燒；
3、使眾生旋轉(zhuǎn)觀聽，雖遇大水所漂，水不能溺；
4、使眾生入于羅剎鬼國，鬼自滅惡；
5、使眾生六根消復(fù)，臨當(dāng)被害，刀段段折壞；
6、菩薩明照十方，使眾生不受藥叉、諸幽冥所害；
7、使眾生不受虛妄聲塵系縛；
8、使眾生行于險路如行坦途，遇賊不受劫；
9、使性多淫者，不生色念；
10、使懷忿記恨之人不生瞋恚；
11、使一切昏鈍無善心之人遠(yuǎn)離癡暗；
12、使無子眾生，欲求男者，令得生男；
13、使無子眾生，欲求女者，即得生女；
14、使眾生持觀音名號者，所得福德與恒河沙數(shù)無異。
按結(jié)構(gòu)分類
從結(jié)構(gòu)上來說，佛珠可以分為兩大類：
單組佛珠：一串佛珠是由一顆母珠和其他規(guī)定不同數(shù)目的子珠組合而成的。
復(fù)組佛珠：一串佛珠，除了母珠和子珠以外，還有隔珠(又稱數(shù)取)、弟子珠、記子留等一些裝飾物。
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