上篇文章談了中醫(yī)的哲學基礎是東方的天人合一，天人相應的整體哲學和含有辯證法的陰陽理論。在東方哲學基礎上，中醫(yī)發(fā)展出了完全不同于西醫(yī)的兩個基本特點：整體性觀點和辨證論治。
什么是中醫(yī)的整體性觀點？實際就是西方科學從上世紀發(fā)展起來的系統(tǒng)工程理論。1940年，美國貝爾實驗室的科學家在研制電話通信網(wǎng)絡時，第一次應用并提出“系統(tǒng)工程”這個名詞，但是它的發(fā)展主要在二戰(zhàn)后。那時，隨著西方科學技術迅猛發(fā)展和融資多樣化，企業(yè)逐步走向規(guī)模經(jīng)濟，進一步的發(fā)展需要縱深和拓寬，而不是傳統(tǒng)式的生產(chǎn)擴大，因而產(chǎn)生了許多企業(yè)和公司的兼并和吞并，形成了跨行業(yè)的大型綜合企業(yè)。綜合性企業(yè)經(jīng)營管理方式復雜，需要把許多原來獨立的生產(chǎn)，人事，采購，科研，培訓，服務，，等等職能看成一個統(tǒng)一的系統(tǒng)，合作協(xié)作調(diào)配管理，才能達到大公司、大企業(yè)追求資本利潤最大化的目標。于是，上世紀，系統(tǒng)工程理論應運而生?！?/span>它的基本特點是：把研究對象作為整體看待，要求對任一對象的研究都必須從它的組成、結(jié)構(gòu)、功能、相互聯(lián)系方式、歷史的發(fā)展和外部環(huán)境等方面進行綜合的考察，做到分析與綜合的統(tǒng)一。（參見《百度百科》）】
最常用的系統(tǒng)工程方法，是系統(tǒng)工程創(chuàng)始人之一的霍爾創(chuàng)立的，稱為三維結(jié)構(gòu)圖：時間維，邏輯維和知識維。從那時起，系統(tǒng)工程理論或稱整體性理論越來越受重視，滲透到各個學科的研究中，如經(jīng)濟學，社會學，心理學，工程學，管理學，，等等。系統(tǒng)工程理論在物理學研究中以量子理論為主旋律，量子理論證明了宇宙萬物有著相關性，整體性。雖然人類還不能證明量子是以什么方式相關的，人類卻已經(jīng)在實踐領域里利用這種相關性實現(xiàn)了遠程通訊。在醫(yī)學上，系統(tǒng)工程理論是以中醫(yī)理論為主旋律的。美國有個整體醫(yī)學協(xié)會（Holistic Medicine Association），它對整體醫(yī)學的解釋是【整體醫(yī)學是在治療中把一個人作為一個整體考慮，（整體）包括身，心，精神，情感，以達到最佳的健康治療效果。按照整體醫(yī)學的觀念，一個人可以用獲得生命平衡的方式達到最佳健康狀態(tài)，這也是整體醫(yī)學實踐的主要目標。（參見整體醫(yī)學協(xié)會網(wǎng)站）】從這段描述可以看到，西方整體醫(yī)學的核心就是中國的中醫(yī)理論。上世紀冷戰(zhàn)時期，大醫(yī)藥公司為了他們的商業(yè)目的，政治家們?yōu)榱死鋺?zhàn)需要，不認可中國的傳統(tǒng)文化，不認可中醫(yī)。認識到中醫(yī)理論偉大的美國醫(yī)生們不得不用“整體醫(yī)學”為名宣傳中醫(yī)的核心理念。冷戰(zhàn)結(jié)束后，隨著中國經(jīng)濟的強大，中國傳統(tǒng)文化越來越多地被西方認識，中醫(yī)在美國也越來越紅火，“整體醫(yī)學”反而沒有中醫(yī)名聲響亮了。
可是在中國，反而有一幫人極力否定中醫(yī)，推崇西醫(yī)。推崇西醫(yī)無錯，否定中醫(yī)卻是錯誤的。中醫(yī)和西醫(yī)一個側(cè)重在整體調(diào)整，是系統(tǒng)工程，一個側(cè)重在部分治療，是分門別類的精細研究。雖然兩者側(cè)重點不同，都匯集于人類健康之同一目的。因此，它們的關系不是對立排斥，是互補雙贏，有些病以西醫(yī)為主較好，有些病以中醫(yī)為主較好。方舟子們不加分析，全面否定中醫(yī)等于否定西方的系統(tǒng)工程理論，說中醫(yī)不是科學等于說西方的系統(tǒng)工程理論不是科學。
系統(tǒng)工程理論是西方人上世紀提出來的，整體醫(yī)學也是在那之后發(fā)展起來的。而在2000多年前，華夏祖先就認識到了天地人是一個復雜而巨大的系統(tǒng)，從而創(chuàng)立了中國的系統(tǒng)工程理論-------中醫(yī)。如果我們用霍爾的三維結(jié)構(gòu)圖方式閱讀成書于戰(zhàn)國時期的《黃帝內(nèi)經(jīng)》，可以發(fā)現(xiàn)該書早就使用三維結(jié)構(gòu)圖分析天地人這個復雜而巨大的系統(tǒng)了。只不過當時沒有更好的量化手段，許多三維結(jié)構(gòu)圖不能像今天西方的系統(tǒng)工程那樣用復雜的數(shù)學公式計算，于是，就像當代的量子力學一樣，華夏祖先就用邏輯推理方式定性，用實踐方法定量，讓人體系統(tǒng)達到最佳狀態(tài)。
《黃帝內(nèi)經(jīng)》從人體生理學，醫(yī)學病理學，醫(yī)學地理學，醫(yī)學物候?qū)W，人體解剖學，人體經(jīng)絡學，，等等各方面進行了精深全面的闡述。它的整體觀念包括了兩層意思：人和自然是一個整體，人體本身也是個整體。人類生活在自然界，自然界為人類生存提供生命需要的食物、空氣。人類的行為改變著自然界，又反過來影響人類的生存環(huán)境。因此，人類跟自然界有著相互作用，有著不可分割的關系，是自然界的一部分，但也有著相對的獨立性和主動性，可以通過養(yǎng)生，治療疾病，保持健康。
人類的身體會隨著自然界變化，產(chǎn)生生理和病理上的反應。夏天，人體皮膚毛孔會張開，便于排汗散熱，適應天氣暑熱。冬天，人體皮膚會致密少汗，以便保持體溫，應對天氣寒冷?！?span style="COLOR: #548dd4; mso-themecolor: text2; mso-themetint: 153">黃帝內(nèi)經(jīng)》說【東方生于春，病在肺，俞在頸項。南風生于夏，病在心，俞在胸脅。西風生于秋，病在肺，俞在肩背。北風生于東，病在腎，俞在腰股?！烤褪俏覀冏嫦瓤偨Y(jié)出人體在四季變化中會產(chǎn)生的病理反應。人體對自然界變化產(chǎn)生的反應不僅表現(xiàn)在四季氣候變化方面，還表現(xiàn)在地理環(huán)境，一天晝夜晨昏變化中。中醫(yī)十二經(jīng)脈氣血流注次序就清楚地解釋了人體在24小時里的活動情況和機能。
除了與自然界相應，中醫(yī)還把人體體內(nèi)看成一個整體。人體的各個部分，如臟腑和臟腑之間，臟腑和形體的各組織器官之間，都是有機的聯(lián)系。這種聯(lián)系從生理和病理上都可以體現(xiàn)出來。中醫(yī)認為心合小腸，主血脈，開竅于舌；肝合膽，主筋，開竅于目；腎合膀胱，主骨，開竅于耳；，，。所以，當舌頭糜爛疼痛時，可以用清小腸火的方法，治療舌頭疼痛。最簡單的單方就是煮碗綠豆水喝喝。這個方法在癥狀初起時非常有效。（注意：綠豆?jié)L一分鐘飲其青綠之水，不能把豆子煮久了。）實火牙痛時，用清胃的方法治療；爆發(fā)火眼時，用清肝方法治療。這些行之有效的治療方法是側(cè)重在部分上的西醫(yī)無法理解的。
前段時間，一個朋友打電話說她父親查出晚期肝癌，她得趕回國去。我建議她不要讓父親動手術，那是用錢損命。用中醫(yī)驅(qū)寒壯陽，以毒攻毒的方法即使治不好，也可以延長生命。可是等朋友趕到國內(nèi)，她父親已經(jīng)在親友和西醫(yī)動員下匆匆忙忙動了手術。朋友說父親手術前還能吃能喝，活動自如，手術后只能臥床，靠輸液維持生命。三個月后，她父親在毫無生命質(zhì)量的痛苦中去世。其實，到目前為止，我聽到和看到的晚期癌癥手術后的狀況都跟上述例子相似。也許西醫(yī)手術是“科學”的，但卻沒達到醫(yī)學之目的！這樣的“科學”即使被方舟子們吹到了天上，也不應該是醫(yī)學的手段。
生命像一團火，人生要不斷地為這團生命之火加油添柴，讓它熊熊燃燒，不要熄滅。癌癥病人一般是極寒體質(zhì)，生命之火已呈微勢。這時，用中醫(yī)方法可以提升正氣（陽氣），增強自身免疫力，特別是練習氣功，調(diào)動內(nèi)在能量，幫助抗擊癌細胞。中醫(yī)的綜合治療就像給生命之火加油添柴，讓“正氣存內(nèi)，邪不可干”。而西醫(yī)手術是進一步傷害元氣，就像在微弱的火上潑水，只能讓生命之火更加微弱，讓病情惡化。這個道理并不難理解，然而許多病人還是選擇了西醫(yī)的手術，這就是對西醫(yī)不分究理的盲目迷信崇拜。
說到這里，我不得不再次強調(diào)上面例子不是要否定西醫(yī)手術，西醫(yī)手術對一些養(yǎng)生失敗的疾病有非常好的效果，如疝氣手術，白內(nèi)障手術，骨質(zhì)增生手術，，等。即便以癌癥為例，在疾病初期，生命之火不太微弱時，在火上噴些水，有時也可以助火燃燒，這就像發(fā)電廠噴射適當?shù)乃簼{可以提高煤電轉(zhuǎn)換效率，失火時卻要用水滅火一樣。所以，我只是想說中西醫(yī)是橘子和蘋果，什么時候吃橘子好，什么時候吃蘋果好，要看具體情況，不能用所謂“科學”一刀切。不論吃橘子，還是吃蘋果，目的都是為了身體健康和活得有質(zhì)量，不是為了其他。因此，醫(yī)學目的和醫(yī)學手段應該統(tǒng)一，這就是系統(tǒng)科學，也是幾千年來的中醫(yī)實踐。
