權歸天王，石達開雖是通軍主將，卻管轄不了天京衛(wèi)戍部隊，衛(wèi)戍部隊直屬于天王管。但石達開在京半年，以自己的行為安定人心，團結臣民，逐漸淡化和消除天京內訌所帶來的負面影響。
同時在各個戰(zhàn)場上，石達開以高明的以守為攻的戰(zhàn)略方針，重振軍威，再展雄風，除了武昌被迫放棄外，江西戰(zhàn)場粉碎了湘軍對九江等幾個重鎮(zhèn)的圍攻，天京周邊強化句容、潥水和鎮(zhèn)江等衛(wèi)星城鎮(zhèn)的防御，特別是支持李秀成、陳玉成在兩淮團結、聯絡十萬捻軍部隊，使他們接受太平天國的領導，聯合作戰(zhàn)。太平天國因內訌所損傷的元氣正在慢慢恢復。
可是，還是那句老話，共患難易同富貴難，洪秀全根深蒂固的家天下思維，使得他對石達開重重顧忌并處處使絆，用他所謂的帝王馭權術，進行了一系列騷操作。
首先改革官制，天王府代替了之前天國的中樞東王府，天王從幕后走向前臺，天王府大肆任用親舊故朋，他們名義上在石達開之下，但有職有權而且可以直通天王府寢殿匯報工作；而石達開變相被架空，加上無名（沒有軍師之職）無實權，難以在天京發(fā)號施令。第二，打破規(guī)制封兩兄長為王，洪秀全迫不及待打破舊例，竟封兩個庸碌無能，且舉止行為令人討厭的長兄洪仁發(fā)為安王，次兄洪仁達為福王，讓他們參政議政并與石達開平起平坐。
洪氏兄弟是朝野以致清廷方面都皆知的蠢材，屢屢犯錯，毫無功勞可言，封他倆為王，全國上下人心不服，都在議論洪天王的用人唯親，鄙視兩新王，偏偏這兩貨還不自知，在朝堂上議論政事時常與石達開抬杠，耍潑，石達開處境很艱難，焦老困苦，竭蹶時形。
飛鳥盡，良弓藏；狡兔死，走狗烹。這是封建皇帝奪得江山、坐穩(wěn)江山后對老伙計們的一大方針，洪秀全目光短淺，他在只占有天京孤城和若干沿江城鎮(zhèn)就已容納不下楊秀清等人了，更遑論孑存的石達開。洪秀全的最終目的，是要建立一個以洪氏家族為核心圈的“家天下”，它與歷代世襲的封建王朝沒有本質區(qū)別。
石達開當時并不是無路可走，他當時有兩條下下策，一是直接宮廷政變，推翻洪秀全的無能統治自己做老大，或者是挾持天王發(fā)號施令，以他當時的威望和人格號召力并不是不可行，他的幕僚張遂謀也建議他如此做；第二條路是接受清廷招安，與大家印象中的可能不太一樣，清廷雖然殺太平軍將領很殘暴，抓住了動不動就是凌遲，但對太平軍的招安工作也一直沒放松，且還算仁慈基本做到承諾，如后來降清的韋志俊，盡管他打死了曾國藩的好友羅澤南，但最后還得了個善終；另一個著名的降清者丁汝昌，后來官至北洋水師提督。
但這兩條路對于義字當先的石達開來講，都是不可能的路，他既不愿同室操戈，也不愿變節(jié)投降，至于所謂的解甲歸田，歸隱山林在這戰(zhàn)火紛飛的大亂世界無疑癡人說夢，所以他只能選擇出走，合則留，不合則去。
1857年6月2日，石達開借口赴南門外雨花臺太平軍駐地巡視，沒有與洪天王打招呼，就帶著曾錦謙，張遂謀等人離開天京，直奔安慶而去，途中為了剖明心跡，沿途貼告示，告示是五言韻文，寫得通俗易懂，但比較長這里只節(jié)選一部分給各位鑒賞：“…去年遭禍亂，狼狽趕回京。自謂此愚衷，定蒙圣鑒明。乃事有不然，詔旨降頻仍。重重生疑忌，一筆難盡陳…”
石達開用一篇韻文體告示，簡明扼要，詞句深沉，寫得有理有利有節(jié)，他對洪秀全的不滿，卻說的心平氣和，娓娓道來，沒有潑婦罵街似的揭露天王對自己的種種不公和猜忌，但這卻更加令洪秀全顏面大失，難以作答。
這篇告示是第一次正式公開石達開和洪秀全的不和，清廷感覺到了機會，咸豐皇帝急令曾國藩設法招安，福濟寫了1200字的信，李元度寫了4500字的信，都送達到了石達開手上，內容大同小異，都是勸降，但也都流露出對他才華出眾，而又懷才不遇的欽佩和惋惜。據說石達開讀了李元度的長信后，只說了一個字：“難”。為什么難？怎樣難？誰也說不清，誰也猜不透。
至此，天京事變第三回合在石達開的負氣出走中落下了帷幕，為期9個月的內訌大戲，在太平天國各方高層人物你方唱罷我登臺中終于譜寫了終章。當初結義的6大天兄天弟，用生命和鮮血背叛了他們最初的誓言，首義6王里獨剩下天王一人在天京城繼續(xù)他的天國大夢，而石達開則越走越遠開啟了另一段昏招迭出走下神壇的故事。
