1697年，康熙皇帝用了八年的時間終于消滅了噶爾丹勢力，從此外蒙古正式納入到了清朝版圖。然而，清朝和準(zhǔn)噶爾汗國的戰(zhàn)爭才剛剛開始。噶爾丹剛服毒自殺，準(zhǔn)噶爾汗國的大汗策妄阿拉布坦就開始和清朝對抗，并且爭奪蒙古高原和青藏高原。兩國在青藏高原的爭奪尤為激烈，最終加速了西藏和青海納入清朝版圖的過程。
策妄阿拉布坦，是原準(zhǔn)噶爾汗國首領(lǐng)僧格的長子。1670年，僧格在內(nèi)亂中被殺，噶爾丹（僧格的弟弟）從西藏返回準(zhǔn)噶爾平定叛亂，自立為大汗，策妄阿拉布坦兄弟被迫依附于噶爾丹。
1688年，噶爾丹擔(dān)心阿拉布坦兄弟反叛，于是派人暗中進行迫害。策妄阿拉布坦的弟弟索諾木阿拉布坦被殺，策妄阿拉布坦則帶領(lǐng)5000部眾逃到了博爾塔拉河，擊敗了噶爾丹的2000追擊。此后，策妄阿拉布坦投靠清朝，占據(jù)準(zhǔn)噶爾本部，阻斷了噶爾丹的退路，加速了噶爾丹的滅亡。
1698年，策妄阿拉布坦正式成為準(zhǔn)噶爾大汗，并將準(zhǔn)噶爾汗國的國力推向了頂峰。第二年，他派遣其弟大策凌敦多布西征哈薩克汗國，擊敗了頭克汗，使哈薩克分裂為大玉茲、中玉茲和小玉茲三部分。他還帶兵和俄國交戰(zhàn)，成功阻止了沙俄的南下。
哈薩克分裂
策妄阿拉布坦非常注重發(fā)展經(jīng)濟，他將大量的南疆維吾爾族工匠遷徙到了伊犁，發(fā)展手工業(yè)，建立了皮革、造紙、布匹、呢絨、印刷等手工業(yè)作坊。當(dāng)時準(zhǔn)噶爾的武器制造業(yè)得到了很大的進步，有專門制造武器的“鄂拓克”5000多戶，專司火炮的“包沁”1000多戶。
1716年，俄國派遣3000軍隊南侵，在亞梅什湖建立了一個據(jù)點。大將策凌敦多布帶領(lǐng)1萬軍隊圍攻亞梅什，最終大敗俄軍。此戰(zhàn)中，準(zhǔn)噶爾俘虜了一名瑞典人，也就是雷納特。他原本是一位瑞典軍官，后來在俄瑞戰(zhàn)爭中被俄國俘虜。
雷納特將俄羅斯視為仇敵，于是就幫助準(zhǔn)噶爾制造火炮，訓(xùn)練炮兵部隊。有了雷納特的幫助，準(zhǔn)噶爾的火炮技術(shù)得以迅速提高，使得準(zhǔn)噶爾擁有了對抗俄國和清朝的資本了。
噶爾丹自殺之前，策妄阿拉布坦一直恭順清朝，然噶爾丹一死，策妄阿拉布坦則公然和清朝抗衡。他派遣軍隊截走了噶爾丹的尸骸及其部下300人，康熙多次下令將他交出，他拒不執(zhí)行。直到第二年，他才在康熙的強硬要求下交出噶爾丹之尸，送回噶爾丹之女鐘齊海等。
多倫會盟后，外蒙古已經(jīng)納入到清朝版圖，策妄阿拉布坦覺得在喀爾喀已經(jīng)沒有擴張的可能，于是他將重點轉(zhuǎn)移到了青藏高原，準(zhǔn)備滅和碩特汗國。
明朝對青藏地區(qū)的管理僅限于名義上的冊封，這給蒙古再次征服青藏高原提供了便利。16世紀(jì)初，蒙古謝布部領(lǐng)主亦不剌為了避達(dá)延汗鋒芒而逃到青海，這是蒙古重返青海的開端。1510年，達(dá)延汗擊潰亦不剌，將青海納入到了蒙古版圖。
隨后，蒙古開始以青海作為據(jù)點，在青藏高原瘋狂擴張。在16世紀(jì)后期，俺答汗又征服了康區(qū)（今川西一帶），并在西藏進行滲透。1577年，俺答汗和西藏格魯派的領(lǐng)袖在青海會盟，正式皈依喇嘛教(藏傳佛教、黃教)，開始了蒙藏一體的道路。
1611年，辛廈巴家族建立了藏巴汗王朝，打壓格魯派，于是格魯派再次請求青海蒙古幫助。隨后，支持噶舉派的喀爾喀蒙古卻圖汗又遠(yuǎn)征青海，使得格魯派再次陷入危機。關(guān)鍵時刻，格魯派請衛(wèi)拉特盟主固始汗幫助。
1636年，固始汗讓侄子鄂齊爾圖汗繼任盟主，自己則帶領(lǐng)衛(wèi)拉特1萬大軍趕往青海，擊潰了卻圖汗，將青海變成了自己的領(lǐng)地。隨后，固始汗又出兵占領(lǐng)了康區(qū)和西藏，滅苯教政權(quán)和藏巴汗王朝，實現(xiàn)青藏高原的統(tǒng)一，建立了強大的和碩特汗國。
1652年，固始汗派遣班禪和達(dá)賴向清朝朝貢，順治皇帝對班禪、達(dá)賴和固始汗進行了冊封，建立了宗藩關(guān)系，這為清朝干預(yù)西藏事務(wù)提供了便利。
然而好景不長。1655年，固始汗去世，和碩特汗國就分裂為了西藏和青海兩部，青海部分由達(dá)什巴圖爾管理，西藏部分由達(dá)延汗管理。和碩特分裂后，西藏的宗教貴族試圖驅(qū)逐蒙古人，使西藏的矛盾變得更加復(fù)雜。
當(dāng)時，西藏宗教首領(lǐng)第巴·桑結(jié)嘉措以以達(dá)賴?yán)锏拿x號令西藏。拉達(dá)克和不丹為了維護噶舉派，就派兵攻打西藏。戰(zhàn)爭一開始，五世達(dá)賴?yán)锞腿ナ懒?，為了不影響軍心?span style="box-sizing: border-box;font-weight: 700;border-width: 0px;border-style: initial;border-color: initial;">桑結(jié)嘉措決定“秘不發(fā)喪”。
第巴·桑結(jié)嘉措
1694年，桑結(jié)嘉措借五世達(dá)賴?yán)锏拿x請求清朝冊封，康熙皇帝冊封桑結(jié)嘉措為“法王”。如此，桑結(jié)嘉措就有了對抗和碩特的實力。此外，他還秘密尋找達(dá)賴轉(zhuǎn)世靈童，最終選中了著名的倉央嘉措。
他還準(zhǔn)噶爾建立了聯(lián)盟。桑結(jié)嘉措曾經(jīng)是噶爾丹的老師，僧格被殺后，他支持噶爾丹回去平叛。他和噶爾丹聯(lián)系的事情激怒了康熙皇帝，康熙皇帝消滅噶爾丹滅對桑結(jié)嘉措問罪，下令查明達(dá)賴?yán)锏恼婕佟?/p>
桑結(jié)嘉措誠惶誠恐，趕緊向康熙皇帝解釋清楚。康熙寬赦了桑結(jié)嘉措，但下令將倉央嘉措押到北京，倉央嘉措行到西寧一帶去世。就在這時候，西藏出現(xiàn)了政變，準(zhǔn)噶爾和清朝將在西藏一決高下。
1701年，西藏達(dá)賴汗去世，其長子旺扎爾繼位。第二年，達(dá)賴汗次子拉藏臺吉毒死其兄竊取了汗位，史稱“拉藏汗”。拉藏汗和桑結(jié)嘉措的矛盾非常突出，兩人爆發(fā)了戰(zhàn)爭，最終桑結(jié)嘉措戰(zhàn)敗被殺。
此后，拉藏汗又將自己私生子認(rèn)定為五世達(dá)賴?yán)镏D(zhuǎn)世靈童，取法名意希嘉措，試圖控制西藏的格魯派。然而，格魯派貴族對拉藏汗的做法表示不滿，他們向康熙告狀。康熙派遣官員來西藏進行審查，結(jié)果因意希嘉措年幼，康熙決定“再閱數(shù)年始議給封”。
為了防止拉藏汗在西藏坐大，康熙皇帝于1709年派遣侍郎赫壽到西藏“協(xié)同拉藏辦理西藏事務(wù)”，這是清朝設(shè)置駐藏大臣的開端。格魯派貴族則堅持反對拉藏汗，他們到康區(qū)擁護達(dá)賴轉(zhuǎn)世靈童格桑嘉措。為了干涉西藏事務(wù)，青海和碩特諸臺吉將格桑嘉措轉(zhuǎn)移到了西寧供養(yǎng)。
1700年的局勢
此時，準(zhǔn)噶爾大汗策妄阿拉布坦也想劫持達(dá)賴號令西藏。早在1706年，策妄阿拉布坦就派人在半路企圖劫持倉央嘉措，但是因為清軍戒備森嚴(yán)而沒有得逞。此后，策妄阿拉布坦和西藏各派建立聯(lián)系，向西藏滲透勢力。
他一方面暗中和格魯派的貴族取得聯(lián)系，煽動格魯派反對拉藏汗；一方面又和拉藏汗聯(lián)姻，使得拉藏汗認(rèn)敵為友，恃親疏防。他準(zhǔn)備派遣軍隊遠(yuǎn)征西藏，為了引開清軍的注意力，他派遣一支2000人的部隊偷襲哈密，又派遣一支300人的部隊去青海，試圖劫持格桑嘉措。這兩個騷擾行動都因為清軍防范嚴(yán)密而失敗。
準(zhǔn)噶爾進軍西藏地圖
1717年，他以護送噶爾丹丹衷回藏和幫助拉藏汗對付不丹為名，讓大策凌敦多布率兵6000人向西藏進軍。在出發(fā)之前，他還放出風(fēng)聲，說準(zhǔn)備再次西征哈薩克。大策凌敦多布的進步十分隱蔽，他們繞過戈壁，翻越了帕米爾高原，涉險冒瘴，晝伏夜行，在悄無聲息之中進入了西藏腹地。
拉藏汗被策妄阿拉布坦的謊言欺騙，疏忽防守。當(dāng)大策凌敦多布軍到達(dá)拉薩，拉藏汗只能倉促應(yīng)戰(zhàn)。而格魯派貴族則紛紛起兵響應(yīng)準(zhǔn)噶爾，拉藏汗走投無路，最終在突圍中被殺死，就這樣，西藏和碩特汗國宣告滅亡。
大策凌敦多布在拉薩進行了大規(guī)模的殺掠，西藏百姓遭到了空前的迫害。隨后，大策凌敦多布繼續(xù)派兵征服西藏各地。面對西藏的變故，康熙皇帝決定派遣大軍遠(yuǎn)征，這就是“驅(qū)準(zhǔn)入藏”的故事了。
